RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBED1-202ENST00000381222 ADGRL2O95490 1459 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 ACEP12821 1306 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 F6X3S4 739 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 MCCP23508 829 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 IGHDP01880 384 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED1-202ENST00000381222 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.4■□□□□ 0.54
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ZBED1-202ENST00000381222 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-202ENST00000381222 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-202ENST00000381222 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.32■□□□□ 0.52
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ZBED1-202ENST00000381222 MBIPQ9NS73 344 aa18.3■□□□□ 0.52
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ZBED1-202ENST00000381222 HSPA2P54652 639 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED1-202ENST00000381222 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ZBED1-202ENST00000381222 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
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ZBED1-202ENST00000381222 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 GBP4Q96PP9 640 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.26■□□□□ 0.51
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ZBED1-202ENST00000381222 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.25■□□□□ 0.51
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ZBED1-202ENST00000381222 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 ST18O60284 1047 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 BTBD11A6QL63 1104 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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