RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 DLC1Q96QB1 1528 aa25.48■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.46■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.678e-6■■□□□ 11.7
PAN3-201ENST00000380958 NLRP1Q9C000 1473 aa25.45■■□□□ 1.67
PAN3-201ENST00000380958 STK26Q9P289 416 aa25.45■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 POGKQ9P215 609 aa25.45■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.45■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.44■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 PRAM1Q96QH2 718 aa25.44■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.44■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 ZMYM3Q14202 1370 aa25.42■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.664e-6■■■□□ 19
PAN3-201ENST00000380958 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.42■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.41■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 ARXQ96QS3 562 aa25.41■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 USP19O94966 1318 aa25.4■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.4■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 RLBP1P12271 317 aa25.39■■□□□ 1.66
PAN3-201ENST00000380958 FYB1O15117 783 aa25.39■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 ATP7BP35670 1465 aa25.39■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.38■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.38■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.38■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.38■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 IL16Q14005 1332 aa25.38■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.37■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.37■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.37■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.36■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.36■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.36■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.35■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 CDK19Q9BWU1 502 aa25.34■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PAN3-201ENST00000380958 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.32■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.31■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.29■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.28■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 TSPOAP1O95153 1857 aa25.28■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 BECN1Q14457 450 aa25.27■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 CABP1Q9NZU7 370 aa25.27■■□□□ 1.64
PAN3-201ENST00000380958 FCHSD2O94868 740 aa25.25■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.25■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.23■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.22■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 RIPK4P57078 832 aa25.21■■□□□ 1.63
PAN3-201ENST00000380958 SIRT1Q96EB6 747 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 ZNF428Q96B54 188 aa25.2■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 TECPR2O15040 1411 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 KIF16BQ96L93 1317 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.19■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.18■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.17■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 POLKQ9UBT6 870 aa25.16■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 CPS1P31327 1500 aa25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 TRIM27P14373 513 aa25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.15■■□□□ 1.62
PAN3-201ENST00000380958 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.14■■□□□ 1.61
PAN3-201ENST00000380958 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PAN3-201ENST00000380958 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PAN3-201ENST00000380958 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.13■■□□□ 1.61
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