RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 BRPF3Q9ULD4 1205 aa34.02■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.01■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.01■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRUQ92729 1446 aa34■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 DIP2AQ14689 1571 aa34■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 PDE3AQ14432 1141 aa34■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 CABP2Q9NPB3 220 aa34■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 BCAR3O75815 825 aa33.99■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 CGNL1Q0VF96 1302 aa33.99■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.98■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 CPS1P31327 1500 aa33.98■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.97■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 USP19O94966 1318 aa33.96■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.95■■■■□ 3.03
PXDC1-202ENST00000380283 IGHDP01880 384 aa33.94■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 CDK19Q9BWU1 502 aa33.94■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.93■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.91■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 PIK3R4Q99570 1358 aa33.9■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.89■■■■□ 3.02
PXDC1-202ENST00000380283 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 CLUAP1Q96AJ1 413 aa33.88■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 CARD14Q9BXL6 1004 aa33.87■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.86■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 AAMPQ13685 434 aa33.84■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 SHPRHQ149N8 1683 aa33.83■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 PTCH1Q13635 1447 aa33.83■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 KCNA6P17658 529 aa33.83■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 WWC1Q8IX03 1113 aa33.82■■■■□ 3.01
PXDC1-202ENST00000380283 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 HSPA2P54652 639 aa33.79■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 BECN1Q14457 450 aa33.78■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.77■■■■□ 3
PXDC1-202ENST00000380283 PANK1Q8TE04 598 aa33.76■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 COG6Q9Y2V7 657 aa33.76■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 SEC24BO95487 1268 aa33.75■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 CABP1Q9NZU7 370 aa33.75■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.74■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.73■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.73■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 CANXP27824 592 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRB2O60241 1585 aa33.71■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.71■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.71■■■□□ 2.99
PXDC1-202ENST00000380283 A0A1W2PP64 1363 aa33.7■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 RARSP54136 660 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.68■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.67■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 FAM43AQ8N2R8 423 aa33.67■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 RUNDC1Q96C34 613 aa33.66■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 USP32Q8NFA0 1604 aa33.65■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 ANTXR1Q9H6X2 564 aa33.65■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 WDR63Q8IWG1 891 aa33.65■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.65■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa33.64■■■□□ 2.98
PXDC1-202ENST00000380283 TBC1D32Q96NH3 1257 aa33.62■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 ATP7BP35670 1465 aa33.62■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 NUTM2FA1L443 756 aa33.61■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa33.61■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC27Q2M243 656 aa33.61■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.58■■■□□ 2.97
PXDC1-202ENST00000380283 RLBP1P12271 317 aa33.57■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 MORC1Q86VD1 984 aa33.57■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa33.56■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 NWD1Q149M9 1564 aa33.54■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 TBC1D2Q9BYX2 928 aa33.51■■■□□ 2.96
PXDC1-202ENST00000380283 NSD2O96028 1365 aa33.51■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.5■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 STRCQ7RTU9 1775 aa33.5■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 NEUROD2Q15784 382 aa33.5■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 FYB1O15117 783 aa33.49■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 TNNQ9UQP3 1299 aa33.49■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa33.49■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.48■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.47■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.47■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.46■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 C14orf37Q86TY3 774 aa33.45■■■□□ 2.95
PXDC1-202ENST00000380283 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms