RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE3AQ14432 1141 aa30.79■■■□□ 2.52
AMIGO1-201ENST00000369862 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.78■■■□□ 2.52
AMIGO1-201ENST00000369862 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
AMIGO1-201ENST00000369862 METP08581 1390 aa30.76■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 PANK1Q8TE04 598 aa30.74■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP7BP35670 1465 aa30.74■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.73■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS3P49796 1198 aa30.71■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 COG6Q9Y2V7 657 aa30.71■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.7■■■□□ 2.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NFKBIBQ15653 356 aa30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A3P48751 1232 aa30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.67■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IGHDP01880 384 aa30.66■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TNRQ92752 1358 aa30.66■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FBLN1P23142 703 aa30.66■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.65■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TNNQ9UQP3 1299 aa30.65■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.65■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.64■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.63■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RLBP1P12271 317 aa30.63■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 POLKQ9UBT6 870 aa30.62■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.62■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TECPR2O15040 1411 aa30.62■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.62■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.6■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 GSE1Q14687 1217 aa30.59■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.59■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CPS1P31327 1500 aa30.59■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.58■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.58■■■□□ 2.49
AMIGO1-201ENST00000369862 RIPK4P57078 832 aa30.57■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 SIRT1Q96EB6 747 aa30.57■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NME9Q86XW9 330 aa30.55■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 AAMPQ13685 434 aa30.54■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 FCHSD2O94868 740 aa30.54■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 IL27Q8NEV9 243 aa30.54■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 IL16Q14005 1332 aa30.53■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.53■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.53■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.52■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.52■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.51■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.51■■■□□ 2.48
AMIGO1-201ENST00000369862 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.51■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.5■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKAR2BP31323 418 aa30.5■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 AKAP12Q02952 1782 aa30.49■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 USP19O94966 1318 aa30.49■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.49■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.48■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 C3P01024 1663 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 ITSN1Q15811 1721 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 LTKP29376 864 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.46■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.45■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
AMIGO1-201ENST00000369862 HMOX1P09601 288 aa30.44■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 IL13P35225 146 aa30.44■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.44■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.42■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 COG3Q96JB2 828 aa30.41■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM27P14373 513 aa30.41■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
AMIGO1-201ENST00000369862 NFE2L2Q16236 605 aa30.38■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC24BO95487 1268 aa30.37■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 BECN1Q14457 450 aa30.36■■■□□ 2.45
AMIGO1-201ENST00000369862 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.35■■■□□ 2.45
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