RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-202ENST00000368205 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRK-202ENST00000368205 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 PDE4DQ08499 809 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 CTHP32929 405 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 WIPF1O43516 503 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.48□□□□□ -0.73
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PTPRK-202ENST00000368205 MAP10Q9P2G4 905 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-202ENST00000368205 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.46□□□□□ -0.73
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PTPRK-202ENST00000368205 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 LILRB3O75022 631 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 NNTQ13423 1086 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 CDK15Q96Q40 435 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRK-202ENST00000368205 LCE2CQ5TA81 110 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 ADH1CP00326 375 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 FOXJ1Q92949 421 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRK-202ENST00000368205 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
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PTPRK-202ENST00000368205 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
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PTPRK-202ENST00000368205 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
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PTPRK-202ENST00000368205 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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PTPRK-202ENST00000368205 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP42Q96MM3 310 aa10.38□□□□□ -0.75
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PTPRK-202ENST00000368205 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-202ENST00000368205 TSC1Q92574 1164 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-202ENST00000368205 STK17AQ9UEE5 414 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-202ENST00000368205 NR5A1Q13285 461 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-202ENST00000368205 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
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PTPRK-202ENST00000368205 NBPF14Q5TI25 921 aa10.35□□□□□ -0.75
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PTPRK-202ENST00000368205 ARID5BQ14865 1188 aa10.34□□□□□ -0.75
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PTPRK-202ENST00000368205 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-202ENST00000368205 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-202ENST00000368205 H3BM21 787 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-202ENST00000368205 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-202ENST00000368205 ITPKCQ96DU7 683 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRK-202ENST00000368205 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-202ENST00000368205 FSHRP23945 695 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 GMPRP36959 345 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 MEIOBQ8N635 442 aa10.26□□□□□ -0.77
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PTPRK-202ENST00000368205 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.24□□□□□ -0.77
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PTPRK-202ENST00000368205 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.24□□□□□ -0.77
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PTPRK-202ENST00000368205 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.23□□□□□ -0.77
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PTPRK-202ENST00000368205 VSIG8P0DPA2 414 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-202ENST00000368205 MAN1A2O60476 641 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-202ENST00000368205 BMP2P12643 396 aa10.2□□□□□ -0.78
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