RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 ERVK-7P63135 1459 aa26.93■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.92■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.92■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.92■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 STAC3Q96MF2 364 aa26.91■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.91■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.91■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 SLC24A1O60721 1099 aa26.89■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 NUCB2P80303 420 aa26.89■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 IFT140Q96RY7 1462 aa26.89■■□□□ 1.9
OPN3-201ENST00000366554 KIF16BQ96L93 1317 aa26.89■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.88■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.88■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.87■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.87■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.86■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.86■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 GPT2Q8TD30 523 aa26.86■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.85■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 AK9Q5TCS8 1911 aa26.85■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.85■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 MORC1Q86VD1 984 aa26.85■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.83■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
OPN3-201ENST00000366554 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.82■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 PREX2Q70Z35 1606 aa26.82■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 PKP1Q13835 747 aa26.82■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 NOS1P29475 1434 aa26.81■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.81■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.8■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 KIF20AO95235 890 aa26.79■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.79■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 RABEP1Q15276 862 aa26.79■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 MTHFSP49914 203 aa26.78■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 ADGRL1O94910 1474 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 ADGRB2O60241 1585 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.77■■□□□ 1.88
OPN3-201ENST00000366554 SYCE3A1L190 88 aa26.76■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.76■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 GCC1Q96CN9 775 aa26.74■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.872e-6■■■□□ 17.1
OPN3-201ENST00000366554 TRPM2O94759 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.73■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 CFAP53Q96M91 514 aa26.73■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.73■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 CDC45O75419 566 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 CBX1P83916 185 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 JPH4Q96JJ6 628 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 PTPRTO14522 1441 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 ABCC11Q96J66 1382 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 TSC1Q92574 1164 aa26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.71■■□□□ 1.87
OPN3-201ENST00000366554 ATP2B3Q16720 1220 aa26.7■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.7■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 RNF214Q8ND24 703 aa26.69■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.69■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.68■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 REREQ9P2R6 1566 aa26.68■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.68■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 CLTCL1P53675 1640 aa26.67■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 MED14O60244 1454 aa26.67■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 CD109Q6YHK3 1445 aa26.67■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 MBD3O95983 291 aa26.65■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 IL16Q14005 1332 aa26.65■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.64■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 USP26Q9BXU7 913 aa26.64■■□□□ 1.86
OPN3-201ENST00000366554 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.64■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.64■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 KIF3AQ9Y496 699 aa26.63■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.63■■□□□ 1.85
OPN3-201ENST00000366554 ERCC6Q03468 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
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