RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.19■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.19■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.19■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 MAPKBP1O60336 1514 aa25.18■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 NFE2L2Q16236 605 aa25.17■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CNTROBQ8N137 903 aa25.16■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CPLX1O14810 134 aa25.16■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.15■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 TRDNQ13061 729 aa25.14■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 IDI1Q13907 227 aa25.14■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.14■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.14■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.14■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 BECN2A8MW95 431 aa25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 ARID3AQ99856 593 aa25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 FANCAO15360 1455 aa25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.13■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 ZNF428Q96B54 188 aa25.12■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 FSD1Q9BTV5 496 aa25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 ATP10BO94823 1461 aa25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.11■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 VPS37DQ86XT2 251 aa25.1■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 TRIM29Q14134 588 aa25.1■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 NOS1P29475 1434 aa25.1■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 BICD2Q8TD16 824 aa25.09■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.09■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 NEK4P51957 841 aa25.09■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.08■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.08■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 RABEP1Q15276 862 aa25.08■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.08■■□□□ 1.61
NISCH-201ENST00000345716 WASHC4Q2M389 1173 aa25.08■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 MARCH6O60337 910 aa25.07■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.05■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 NME9Q86XW9 330 aa25.05■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.05■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.04■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 PSMA5P28066 241 aa25.04■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 MSH5O43196 834 aa25.03■■□□□ 1.6
NISCH-201ENST00000345716 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.03■■□□□ 1.6
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NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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NISCH-201ENST00000345716 FOSBP53539 338 aa25.02■■□□□ 1.6
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NISCH-201ENST00000345716 TRAK2O60296 914 aa25.01■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.01■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 MCM2P49736 904 aa25.01■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 ABCC11Q96J66 1382 aa25■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 MCM10Q7L590 875 aa25■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 DCTN1Q14203 1278 aa25■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 PLCH2O75038 1416 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 CABP4P57796 275 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 ERICH2A1L162 156 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 HIP1O00291 1037 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 SPG7Q9UQ90 795 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 VPS53Q5VIR6 699 aa24.98■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 IFT57Q9NWB7 429 aa24.98■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.98■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.97■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.97■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 BTBD11A6QL63 1104 aa24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.96■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 SKAP1Q86WV1 359 aa24.95■■□□□ 1.59
NISCH-201ENST00000345716 MRE11P49959 708 aa24.95■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 SRGAP3O43295 1099 aa24.95■■□□□ 1.58
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