RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320225.9

RNPS1-202, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-202ENST00000320225 FANCAO15360 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 NOS1P29475 1434 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 KIF1BO60333 1816 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 CD109Q6YHK3 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.14■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 PTMSP20962 102 aa22.14■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.14■■□□□ 1.14
RNPS1-202ENST00000320225 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 CFAP53Q96M91 514 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 LNPKQ9C0E8 428 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 OFD1O75665 1012 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 SSFA2P28290 1259 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 RIPK4P57078 832 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 AK9Q5TCS8 1911 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 ADGRB1O14514 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-202ENST00000320225 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 ABCC11Q96J66 1382 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 TERF1P54274 439 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 ADGRB3O60242 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 MED14O60244 1454 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 IL16Q14005 1332 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF445P59923 1031 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 NSD2O96028 1365 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 PPLO60437 1756 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 KIF16BQ96L93 1317 aa22.02■■□□□ 1.12
RNPS1-202ENST00000320225 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 HS1BP3Q53T59 392 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 PDLIM2Q96JY6 352 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 RBSNQ9H1K0 784 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 GCC1Q96CN9 775 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 NPATQ14207 1427 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 ASXL2Q76L83 1435 aa21.97■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 REREQ9P2R6 1566 aa21.96■■□□□ 1.11
RNPS1-202ENST00000320225 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 PIK3R4Q99570 1358 aa21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 MCTP1Q6DN14 999 aa21.94■■□□□ 1.1
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