RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 TPM2P07951 284 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 WDR63Q8IWG1 891 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.61■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.6■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.6■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 GLI2P10070 1586 aa23.59■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.59■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 EVC2Q86UK5 1308 aa23.58■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 DDIT3P35638 169 aa23.58■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 OSCARQ8IYS5 282 aa23.58■■□□□ 1.37
CNOT11-201ENST00000289382 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 FBLN1P23142 703 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 CFAP53Q96M91 514 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 A0A1W2PP64 1363 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC27Q2M243 656 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 GBP4Q96PP9 640 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT11-201ENST00000289382 PRAM1Q96QH2 718 aa23.5■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 SMC5Q8IY18 1101 aa23.49■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 SNX21Q969T3 373 aa23.48■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.48■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.48■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM27P14373 513 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 FYB1O15117 783 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 PIK3C2BO00750 1634 aa23.47■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.46■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.46■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.46■■□□□ 1.35
CNOT11-201ENST00000289382 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.45■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 USP32Q8NFA0 1604 aa23.44■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 PTMSP20962 102 aa23.44■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.44■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.43■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 ABCC11Q96J66 1382 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 OFD1O75665 1012 aa23.41■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 CABP1Q9NZU7 370 aa23.4■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.4■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.4■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.39■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.39■■□□□ 1.34
CNOT11-201ENST00000289382 PTPRMP28827 1452 aa23.39■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 CDK19Q9BWU1 502 aa23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 RIPK4P57078 832 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 LNPKQ9C0E8 428 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 NSD2O96028 1365 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 ADGRB2O60241 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 NEO1Q92859 1461 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 KIF2CQ99661 725 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 SSFA2P28290 1259 aa23.34■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CNOT11-201ENST00000289382 NUCB1Q02818 461 aa23.34■■□□□ 1.33
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