RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 NGEFQ8N5V2 710 aa19.21■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.21■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.21■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.21■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 ADGRB2O60241 1585 aa19.2■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.2■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 PIK3R4Q99570 1358 aa19.2■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.19■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.19■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 POLKQ9UBT6 870 aa19.19■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 SLFN5Q08AF3 891 aa19.18■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 WWC1Q8IX03 1113 aa19.17■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 ITSN1Q15811 1721 aa19.16■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.16■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 E9PSI1 815 aa19.15■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.15■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.15■□□□□ 0.66
NICN1-201ENST00000273598 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.14■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.13■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 AKAP12Q02952 1782 aa19.13■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.13■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.13■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 PLIN1O60240 522 aa19.12■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 USP6P35125 1406 aa19.12■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 C14orf37Q86TY3 774 aa19.11■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.1■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 SOX12O15370 315 aa19.09■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.09■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.09■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 NEFMP07197 916 aa19.08■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.08■□□□□ 0.65
NICN1-201ENST00000273598 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.08■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 CCDC27Q2M243 656 aa19.07■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 WDR63Q8IWG1 891 aa19.07■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 FCHSD2O94868 740 aa19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 HMOX1P09601 288 aa19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.06■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.05■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 PRKAR2BP31323 418 aa19.05■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 IL13P35225 146 aa19.04■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 RIPK4P57078 832 aa19.04■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.02■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.02■□□□□ 0.64
NICN1-201ENST00000273598 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.02■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.02■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 NLRP6P59044 892 aa19.02■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.02■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.02■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 SSH2Q76I76 1423 aa19.01■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.01■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.01■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 FMN2Q9NZ56 1722 aa19■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 BCAR3O75815 825 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 ABTB2Q8N961 1025 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 CRBNQ96SW2 442 aa18.99■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.98■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.98■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 HSPA2P54652 639 aa18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 PSME1Q06323 249 aa18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 USP31Q70CQ4 1352 aa18.97■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 AMPHP49418 695 aa18.96■□□□□ 0.63
NICN1-201ENST00000273598 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.95■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 NFE2L2Q16236 605 aa18.94■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.93■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 ORAI2Q96SN7 254 aa18.92■□□□□ 0.62
NICN1-201ENST00000273598 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms