RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 SPC24Q8NBT2 197 aa24.44■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.43■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 ABTB2Q8N961 1025 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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ZBED3-201ENST00000255198 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.41■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 NEK4P51957 841 aa24.41■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 FIBPO43427 364 aa24.41■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 SIL1Q9H173 461 aa24.41■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 TSPY26PQ9H489 355 aa24.4■■□□□ 1.5
ZBED3-201ENST00000255198 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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ZBED3-201ENST00000255198 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.39■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.39■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 NFKBIBQ15653 356 aa24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 PTPRGP23470 1445 aa24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 MIA2Q96PC5 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 SERPINC1P01008 464 aa24.37■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.37■■□□□ 1.49
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ZBED3-201ENST00000255198 DEF6Q9H4E7 631 aa24.36■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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ZBED3-201ENST00000255198 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 GNAI3P08754 354 aa24.35■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 MPNDQ8N594 471 aa24.34■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC69A6NI79 296 aa24.34■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 ERLIN2O94905 339 aa24.33■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
ZBED3-201ENST00000255198 TRAK2O60296 914 aa24.33■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 MTHFSP49914 203 aa24.33■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.33■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 MRE11P49959 708 aa24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC181Q5TID7 509 aa24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 MYL6BP14649 208 aa24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 HIP1O00291 1037 aa24.31■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 CENPHQ9H3R5 247 aa24.31■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.31■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 PRKAR2BP31323 418 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 CABP4P57796 275 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 CCP110O43303 1012 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SOGA3Q5TF21 947 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 GNAI2P04899 355 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SMARCA2P51531 1590 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 ME1P48163 572 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 FAM193AP78312 1265 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.27■■□□□ 1.48
ZBED3-201ENST00000255198 SLC4A2P04920 1241 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 PDCP20941 246 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 STIM1Q13586 685 aa24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.25■■□□□ 1.47
ZBED3-201ENST00000255198 NEBLO76041 1014 aa24.25■■□□□ 1.47
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