RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233027.9

NEK4-201, Transcript of NIMA related kinase 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK4, Length 6,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4-201ENST00000233027 ATP2B1P20020 1258 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 STK3Q13188 491 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 CAGE1Q8TC20 777 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 GCC1Q96CN9 775 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 PDE3AQ14432 1141 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 ARAP1Q96P48 1450 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 GNAI3P08754 354 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK4-201ENST00000233027 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 KINO60870 393 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 NLRP6P59044 892 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 GNAI2P04899 355 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 WDR97A6NE52 1622 aa16■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SLC4A2P04920 1241 aa16■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 FAM177BA6PVY3 158 aa16■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 EPS15P42566 896 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 MCM2P49736 904 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.153e-7■■■□□ 17
NEK4-201ENST00000233027 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 PRAM1Q96QH2 718 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SKAP1Q86WV1 359 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 SIL1Q9H173 461 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 STAC3Q96MF2 364 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 MAP7D2Q96T17 732 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 XBP1P17861 261 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 AFAP1Q8N556 730 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 STK38Q15208 465 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK4-201ENST00000233027 ABTB2Q8N961 1025 aa15.96■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 TNMDQ9H2S6 317 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 OFD1O75665 1012 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ERBINQ96RT1 1412 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 HIP1O00291 1037 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 UQCRHP07919 91 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 PDCP20941 246 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CDR1P51861 262 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CCDC192P0DO97 292 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SERPINC1P01008 464 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CDK19Q9BWU1 502 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 WDR63Q8IWG1 891 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 MCM4P33991 863 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SMARCE1Q969G3 411 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CABP1Q9NZU7 370 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 H0YHG0 523 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ME1P48163 572 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ODF2Q5BJF6 829 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 SYNJ1O43426 1573 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 ATF3P18847 181 aa15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 CCP110O43303 1012 aa15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NEK4-201ENST00000233027 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms