RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa29.89■■■□□ 2.38
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nfat5Q9WV30 1534 aa29.58■■■□□ 2.33
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa29.48■■■□□ 2.31
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Astn2Q80Z10 1352 aa29.31■■■□□ 2.28
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PrxO55103 1391 aa29.28■■■□□ 2.28
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Magea5O89009 320 aa29.26■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pank3Q8R2W9 370 aa29.26■■■□□ 2.27
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm21671G3UY31 267 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plekhg5Q66T02 1073 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcnh5Q920E3 988 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ubr1O70481 1757 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kat6bQ8BRB7 1872 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Scn7aB1AYL1 1681 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CemipQ8BI06 1361 aa29.19■■■□□ 2.26
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gpr150Q8BL07 427 aa29.16■■■□□ 2.26
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