RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 VRK3Q8IV63 474 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 P3H2Q8IVL5 708 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 IL17REQ8NFR9 667 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AFG1LQ8WV93 481 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 HMGB4Q8WW32 186 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CPT1BQ92523 772 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CAVIN3Q969G5 261 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MECRQ9BV79 373 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SNX15Q9NRS6 342 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PDP2Q9P2J9 529 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AMFRQ9UKV5 643 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LZTS1Q9Y250 596 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 B8ZZF3 427 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CA12O43570 354 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SH3BP5O60239 455 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LARGE1O95461 756 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ADH4P08319 380 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NPSP0C0P6 89 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ELFN1P0C7U0 828 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EBLN1P0CF75 366 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ALADP13716 330 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFB7P17568 137 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MMP8P22894 467 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MCM2P49736 904 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DIO1P49895 249 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DNASE1L3Q13609 305 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RPS6KA2Q15349 733 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAM187BQ17R55 369 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AAK1Q2M2I8 961 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZPA2 131 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RINLQ6ZS11 566 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 HERVK_113Q902F9 699 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NPIPB3Q92617 1050 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RASSF1Q9NS23 344 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NCANO14594 1321 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1B0GVC2 190 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 E7EVH7 732 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 M0QYT0 321 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 QSOX1O00391 747 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PRRG2O14669 202 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MATN3O15232 486 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 NKX2-8O15522 239 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SUV39H1O43463 412 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ORC4O43929 436 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 AGR2O95994 175 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PYGLP06737 847 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CYP21A2P08686 494 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DRD4P21917 467 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FPR3P25089 353 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MCM7P33993 719 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 THBS4P35443 961 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CCT8P50990 548 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms