RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZNX1 250 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 Q6YL49 198 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TTPALQ9BTX7 342 aa3.59□□□□□ -1.83
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