RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	SUV3	P32580	737 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	HXT5	P38695	592 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	RLF2	Q12495	606 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	MLF3	P32047	452 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	UBX7	P38349	436 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RIO2	YNL207W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	VAN1	P23642	535 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	SPR3	P41901	512 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	CAB1	Q04430	367 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	SCD5	P34758	872 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	INP52	P50942	1183 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	TAF7	Q05021	590 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	TRS33	Q99394	268 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	RGP1	P16664	663 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	MSC7	P38694	644 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	YTA6	P40328	754 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	YBR197C	P38306	217 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	SKP1	P52286	194 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	RPC31	P17890	251 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
RIO2	YNL207W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	AVT1	P47082	602 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	NHA1	Q99271	985 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RIO2	YNL207W	MRPL33	P20084	86 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	KAP122	P32767	1081 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	CWH41	P53008	833 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	MTO1	P53070	669 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	SRS2	P12954	1174 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	QDR2	P40474	542 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	VMA3	P25515	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	ALG14	P38242	237 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	YNR040W	P53736	256 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	PUN1	Q06991	263 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	ISC10	P32645	267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	KTR2	P33550	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	BUD9	P53226	547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	PNP1	Q05788	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	PRK1	P40494	810 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RIO2	YNL207W	ITC1	P53125	1264 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	HEH2	Q03281	663 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	BSD2	P38356	321 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	APM2	P38700	605 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	BOL3	P39724	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	APC11	Q12157	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	AI3	P03877	415 aa		5	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	COQ2	P32378	372 aa		5	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	DYS1	P38791	387 aa		5	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	MED7	Q08278	222 aa		5	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	LSO1	Q3E827	93 aa		5	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	IDI1	P15496	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	LIP5	P32875	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	LDH1	P38139	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	MRP10	O75012	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	SAC7	P17121	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	RPB10	P22139	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	MSN1	P22148	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	GIP1	P38229	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	AOS1	Q06624	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RIO2	YNL207W	KAE1	P36132	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	RRN6	P32786	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	ISW1	P38144	1129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	RRM3	P38766	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	HXT8	P40886	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	RGD2	P43556	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	YIL165C	P40446	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	GIS4	Q04233	774 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	YKR073C	P36153	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	TOS1	P38288	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	GAS5	Q08193	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	SFA1	P32771	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	KAR5	Q04746	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	TRP3	P00937	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	GEF1	P37020	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	NTA1	P40354	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	PPT1	P53043	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIO2	YNL207W	ATG1	P53104	897 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.5 ms