RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	OSW7	P43611	510 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	VTC4	P47075	721 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	BDS1	Q08347	646 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	PHM7	Q12252	991 aa		5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	TEC1	P18412	486 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	SPC42	P36094	363 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	MDG1	P53885	366 aa		5.67	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	FBP26	P32604	452 aa		5.66	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
KTR2	YKR061W	DFG5	Q05031	458 aa		5.66	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	STE6	P12866	1290 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	JJJ3	P47138	172 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	ATG36	P46983	293 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	RAD59	Q12223	238 aa		5.64	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	CCP1	P00431	361 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	HEM3	P28789	327 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	RRN6	P32786	894 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	YJR008W	P47085	338 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	HPC2	Q01448	625 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	BNR1	P40450	1375 aa		5.63	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	GUT2	P32191	649 aa		5.62	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	SIS2	P36024	562 aa		5.61	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	SRB8	P25648	1427 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	YAF9	P53930	226 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.6	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	DAL1	P32375	460 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	ISU1	Q03020	165 aa		5.59	□□□□□ -1.51
KTR2	YKR061W	OCA5	P38738	679 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	ATG20	Q07528	640 aa		5.58	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	YAP3	P38749	330 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	TPO2	P53283	614 aa		5.57	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	AI1	P03875	834 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	TFB3	Q03290	321 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	FRA1	Q07825	749 aa		5.56	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	CEM1	P39525	442 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	NNF1	P47149	201 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	NSG2	P53898	299 aa		5.55	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	DNF3	Q12674	1656 aa		5.54	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	CSE4	P36012	229 aa		5.54	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	CUZ1	P53899	274 aa		5.54	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	UBP15	P50101	1230 aa		5.53	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	MSN5	P52918	1224 aa		5.53	□□□□□ -1.52
KTR2	YKR061W	SSM4	P40318	1319 aa		5.52	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	TOA1	P32773	286 aa		5.52	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	TOM20	P35180	183 aa		5.52	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	IPL1	P38991	367 aa		5.51	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	UBX5	Q06682	500 aa		5.51	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	DIT1	P21623	536 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	MDJ1	P35191	511 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.5	□□□□□ -1.53	not detected
KTR2	YKR061W	MAK10	Q02197	733 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	THI72	Q08579	599 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	HIF1	Q12373	385 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.5	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	VMR1	P38735	1592 aa		5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	BIM1	P40013	344 aa		5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	YFL066C	P43538	392 aa		5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	SYT1	Q06836	1226 aa		5.48	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	TBS1	P38114	1094 aa		5.47	□□□□□ -1.53
KTR2	YKR061W	ATG3	P40344	310 aa		5.47	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60 ms