RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	NSG2	P53898	299 aa		6.44	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.43	□□□□□ -1.38	not detected
PEX18	YHR160C	ISC10	P32645	267 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	SKP1	P52286	194 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	YNR040W	P53736	256 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	SRS2	P12954	1174 aa		6.42	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	RPC31	P17890	251 aa		6.42	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	PNP1	Q05788	311 aa		6.4	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	PHM7	Q12252	991 aa		6.4	□□□□□ -1.38
PEX18	YHR160C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	APM2	P38700	605 aa		6.39	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	PRK1	P40494	810 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	YNR014W	P53719	212 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	HEH2	Q03281	663 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	MTC5	Q03897	1148 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	TDA6	Q06466	467 aa		6.38	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	BSD2	P38356	321 aa		6.37	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	DYS1	P38791	387 aa		6.37	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	ITC1	P53125	1264 aa		6.37	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	LDH1	P38139	375 aa		6.36	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.36	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	BOI2	P39969	1040 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	MRP10	O75012	95 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PEX18	YHR160C	MSN1	P22148	382 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	GIP1	P38229	639 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	BOL3	P39724	118 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	IDI1	P15496	288 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	RRN6	P32786	894 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	KTR2	P33550	425 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	RPB10	P22139	70 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	MET1	P36150	593 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	YMR187C	Q03236	431 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	ISW1	P38144	1129 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	HXT8	P40886	569 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	LSO1	Q3E827	93 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	ALG14	P38242	237 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	APC11	Q12157	165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	GIS4	Q04233	774 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PEX18	YHR160C	SKN7	P38889	622 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	YIL165C	P40446	119 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	RGD2	P43556	714 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	YDR215C	Q12240	137 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	NHA1	Q99271	985 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	FIR1	P40020	876 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	YJL181W	P46987	611 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	PRY1	P47032	299 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	KAR5	Q04746	504 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	PPT1	P53043	513 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	AIM46	P38885	310 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	MCA1	Q08601	432 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	RAD55	P38953	406 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	NTA1	P40354	457 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PEX18	YHR160C	QDR1	P40475	563 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	RSC2	Q06488	889 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	GAS5	Q08193	484 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	GEF1	P37020	779 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	BUD9	P53226	547 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	SMC1	P32908	1225 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	TAT1	P38085	619 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	YBR287W	P38355	427 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	RRM3	P38766	723 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	TED1	P40533	473 aa		6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	GIP2	P40036	548 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	PSY2	P40164	858 aa		6.18	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	TFA2	P36145	328 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	ATG1	P53104	897 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	ALD3	P54114	506 aa		6.17	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	LSB6	P42951	607 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	SLP1	Q12232	587 aa		6.15	□□□□□ -1.42
PEX18	YHR160C	HAT1	Q12341	374 aa		6.15	□□□□□ -1.42

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