RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 PDE4CQ08493 712 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 USP47Q96K76 1375 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 SLC4A3P48751 1232 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 MCM2P49736 904 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 TSPY26PQ9H489 355 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 TRAK2O60296 914 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 OFD1O75665 1012 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 CPLX1O14810 134 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-209ENST00000612229 TRDNQ13061 729 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PDCP20941 246 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SOX12O15370 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 TXLNAP40222 546 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM22Q9NS69 142 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DACH1Q9UI36 760 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 ERC2O15083 957 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PSMA5P28066 241 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM5Q9C035 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 LUZP1Q86V48 1076 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 STK26Q9P289 416 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC175P0C221 793 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DDX12PQ92771 950 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 KINO60870 393 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CDC45O75419 566 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PLIN1O60240 522 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 MAP9Q49MG5 647 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 UQCRHP07919 91 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PANK3Q9H999 370 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 COG6Q9Y2V7 657 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 MIA2Q96PC5 1412 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC192P0DO97 292 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 EVC2Q86UK5 1308 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 PDILTQ8N807 584 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 JMYQ8N9B5 988 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 STIM1Q13586 685 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 KIF21BO75037 1637 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 GBP3Q9H0R5 595 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 SDF4Q9BRK5 362 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-209ENST00000612229 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-209ENST00000612229 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.27□□□□□ -1.09
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