RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	AGL	P35573	1532 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	RGS3	P49796	1198 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	TNR	Q92752	1358 aa		12.97	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	12.96	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.96	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	LAMC1	P11047	1609 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0G2JS52	829 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	EID1	Q9Y6B2	187 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	APAF1	O14727	1248 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3C2B	O00750	1634 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	IQGAP1	P46940	1657 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PPL	O60437	1756 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CTCFL-222	ENST00000609232	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	CDK19	Q9BWU1	502 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	IFT172	Q9UG01	1749 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	HMOX1	P09601	288 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	APBB1	O00213	710 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	LTK	P29376	864 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	CABP1	Q9NZU7	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A3	P48751	1232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CTCFL-222	ENST00000609232	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	MET	P08581	1390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP53	Q96M91	514 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	MTHFS	P49914	203 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	BCAR3	O75815	825 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	NUDC	Q9Y266	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNA4	P22459	653 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC11	Q96J66	1382 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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