RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		18.97	■□□□□ 0.63
NUP62-216	ENST00000599560	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		18.97	■□□□□ 0.63
NUP62-216	ENST00000599560	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
NUP62-216	ENST00000599560	PXDN	Q92626	1479 aa		18.97	■□□□□ 0.63
NUP62-216	ENST00000599560	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
NUP62-216	ENST00000599560	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	SLIT2	O94813	1529 aa		18.93	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	CLTCL1	P53675	1640 aa		18.92	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	HRC	P23327	699 aa		18.91	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	NUP155	O75694	1391 aa		18.91	■□□□□ 0.62
NUP62-216	ENST00000599560	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		18.89	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		18.88	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FOXO3	O43524	673 aa		18.87	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	USP32	Q8NFA0	1604 aa		18.86	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		18.86	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		18.85	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	APLP2	Q06481	763 aa		18.85	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		18.85	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KIF1B	O60333	1816 aa		18.84	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		18.84	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		18.83	■□□□□ 0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NUTM2F	A1L443	756 aa		18.81	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ROCK1	Q13464	1354 aa		18.81	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ABCA3	Q99758	1704 aa		18.8	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	VPS72	Q15906	364 aa		18.78	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		18.77	■□□□□ 0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NAIP	Q13075	1403 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PPL	O60437	1756 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FAM182B	Q5T319	152 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		18.76	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PLEKHG5	O94827	1062 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	BAG6	P46379	1132 aa		18.75	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NRAP	Q86VF7	1730 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		18.74	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	YY1	P25490	414 aa		18.72	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		18.72	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		18.71	■□□□□ 0.59
NUP62-216	ENST00000599560	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	KIF1A	Q12756	1690 aa		18.7	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	ITGAE	P38570	1179 aa		18.7	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		18.69	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	FAM83G	A6ND36	823 aa		18.68	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		18.67	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560		A0A0G2JS52	829 aa		18.67	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	MYT1	Q01538	1121 aa		18.67	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		18.66	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	IFT172	Q9UG01	1749 aa		18.66	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	DISP2	A7MBM2	1401 aa		18.66	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	STK26	Q9P289	416 aa		18.65	■□□□□ 0.58
NUP62-216	ENST00000599560	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		18.64	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	TECPR2	O15040	1411 aa		18.64	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		18.63	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		18.63	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		18.62	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		18.62	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		18.61	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	RREB1	Q92766	1687 aa		18.61	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		18.6	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	BTG4	Q9NY30	223 aa		18.59	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.57
NUP62-216	ENST00000599560	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		18.58	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		18.57	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	SBNO1	A3KN83	1393 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	ABCC11	Q96J66	1382 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM37	O94972	964 aa		18.56	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	ALS2	Q96Q42	1657 aa		18.55	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRB2	O60241	1585 aa		18.54	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	PSME1	Q06323	249 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGEF10	O15013	1369 aa		18.53	■□□□□ 0.56
NUP62-216	ENST00000599560	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		18.51	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	APBA3	O96018	575 aa		18.5	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	RGL3	Q3MIN7	710 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	PIK3C2G	O75747	1445 aa		18.47	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		18.46	■□□□□ 0.55

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