RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.27	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.26	■■■□□ 2.12
ILF3-223	ENST00000593061	ORAI2	Q96SN7	254 aa		28.26	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ILF3-223	ENST00000593061	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	NUTM2F	A1L443	756 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ILF3-223	ENST00000593061	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	SIRT1	Q96EB6	747 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	PRAM1	Q96QH2	718 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	ADGRB1	O14514	1584 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	DLC1	Q96QB1	1528 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ILF3-223	ENST00000593061	FOXO3	O43524	673 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	POGK	Q9P215	609 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	AFF2	P51816	1311 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	PXDN	Q92626	1479 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ILF3-223	ENST00000593061	ADGRB2	O60241	1585 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ILF3-223	ENST00000593061	NGLY1	Q96IV0	654 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ILF3-223	ENST00000593061	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
ILF3-223	ENST00000593061	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
ILF3-223	ENST00000593061	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
ILF3-223	ENST00000593061	RXRB	P28702	533 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ILF3-223	ENST00000593061	PSME1	Q06323	249 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	USP21	Q9UK80	565 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	PLEKHG5	O94827	1062 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ILF3-223	ENST00000593061	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	SBNO1	A3KN83	1393 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	RGS12	O14924	1447 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	ITSN1	Q15811	1721 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	NEUROD1	Q13562	356 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	ABCA3	Q99758	1704 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ILF3-223	ENST00000593061	ATP7B	P35670	1465 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	ARHGEF10	O15013	1369 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	ATRN	O75882	1429 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	CDK19	Q9BWU1	502 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	ALS2	Q96Q42	1657 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
ILF3-223	ENST00000593061	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	SLIT2	O94813	1529 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ILF3-223	ENST00000593061	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
ILF3-223	ENST00000593061	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ILF3-223	ENST00000593061	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ILF3-223	ENST00000593061	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		27.61	■■■□□ 2.01

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