RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.77	□□□□□ -0.36
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC24A1	O60721	1099 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.74	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.73	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		12.73	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.73	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.72	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.72	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK19	Q9BWU1	502 aa		12.71	□□□□□ -0.37
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	C14orf37	Q86TY3	774 aa		12.7	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM94	Q12767	1356 aa		12.69	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRB2	O60241	1585 aa		12.68	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.68	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.67	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMC1	Q8TDI8	760 aa		12.67	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.67	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		12.66	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.66	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.66	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		12.65	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		12.65	□□□□□ -0.38
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		12.64	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	PANK3	Q9H999	370 aa		12.64	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		12.64	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.64	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYOM1	P52179	1685 aa		12.64	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP7B	P35670	1465 aa		12.63	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	CABP1	Q9NZU7	370 aa		12.63	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSH6	P52701	1360 aa		12.61	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		12.61	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.61	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATF3	P18847	181 aa		12.61	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		12.61	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.6	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.6	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		12.6	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		12.59	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.59	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCC	P43146	1447 aa		12.59	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.59	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.58	□□□□□ -0.39
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PP64	1363 aa		12.58	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		12.58	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		12.58	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.57	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.57	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.57	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	MST1R	Q04912	1400 aa		12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACE	P12821	1306 aa		12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.56	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		12.55	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.55	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITSN1	Q15811	1721 aa		12.55	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLAIN2	Q9P270	581 aa		12.54	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANP32C	O43423	234 aa		12.52	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXO3	O43524	673 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIER1	Q8N108	512 aa		12.52	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.52	□□□□□ -0.41	8e-7	■■□□□ 12.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP6	P35125	1406 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.51	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP12	Q02952	1782 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.5	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSME1	Q06323	249 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	FYB1	O15117	783 aa		12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.48	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	NME9	Q86XW9	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 214 ms