RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 NPATQ14207 1427 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 PTMSP20962 102 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 REREQ9P2R6 1566 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNC1I1O14576 645 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 RGL3Q3MIN7 710 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 DAPK1P53355 1430 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 NUP155O75694 1391 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM161AQ3B820 660 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 VGLL3A8MV65 326 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 C3P01024 1663 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 NCOA1Q15788 1441 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 PANK2Q9BZ23 570 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 RIPK4P57078 832 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 IDI1Q13907 227 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 C14orf37Q86TY3 774 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 TOM1O60784 492 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPRTO14522 1441 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 CLGNO14967 610 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 UQCRHP07919 91 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 PZPP20742 1482 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 PLXNC1O60486 1568 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 LTKP29376 864 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ARID3AQ99856 593 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 RGS22Q8NE09 1264 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 APPP05067 770 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ROCK1Q13464 1354 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ERBB4Q15303 1308 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TMC1Q8TDI8 760 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC7Q96M83 1385 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC184Q52MB2 194 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAK2O60296 914 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ERBINQ96RT1 1412 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP1Q9C000 1473 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCC3O15438 1527 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 MCM4P33991 863 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC20A2Q08357 652 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC66A2RUB6 948 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 ERVK-7P63135 1459 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-218ENST00000590367 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 PLA2R1Q13018 1463 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms