RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 ESCO1Q5FWF5 840 aa38.18■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 STK26Q9P289 416 aa38.18■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.15■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.15■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa38.14■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 NPHP3Q7Z494 1330 aa38.14■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 RGS12O14924 1447 aa38.14■■■■□ 3.7
E2F4-213ENST00000569573 USP21Q9UK80 565 aa38.12■■■■□ 3.69
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.1■■■■□ 3.69
E2F4-213ENST00000569573 WAPLQ7Z5K2 1190 aa38.08■■■■□ 3.69
E2F4-213ENST00000569573 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
E2F4-213ENST00000569573 NUTM2FA1L443 756 aa38.06■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 TECPR2O15040 1411 aa38.05■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 FOXO3O43524 673 aa38.05■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 TMEM132EQ6IEE7 984 aa38.05■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 IFT172Q9UG01 1749 aa38.03■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 ABCC11Q96J66 1382 aa38.02■■■■□ 3.68
E2F4-213ENST00000569573 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 PIK3C2GO75747 1445 aa38■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 PXDNQ92626 1479 aa38■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 MYOM2P54296 1465 aa37.97■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.97■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.97■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
E2F4-213ENST00000569573 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.94■■■■□ 3.66
E2F4-213ENST00000569573 ATRNO75882 1429 aa37.91■■■■□ 3.66
E2F4-213ENST00000569573 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.88■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 KIF1AQ12756 1690 aa37.85■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 SIRT1Q96EB6 747 aa37.85■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 BCL9LQ86UU0 1499 aa37.83■■■■□ 3.65
E2F4-213ENST00000569573 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.82■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.82■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa37.82■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 PHF8Q9UPP1 1060 aa37.78■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.77■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 PSME1Q06323 249 aa37.77■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 PRAM1Q96QH2 718 aa37.76■■■■□ 3.64
E2F4-213ENST00000569573 POGKQ9P215 609 aa37.74■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 UNC5CLQ8IV45 518 aa37.73■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHG5O94827 1062 aa37.71■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.71■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.7■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.7■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
E2F4-213ENST00000569573 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 USP32Q8NFA0 1604 aa37.68■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 SLIT2O94813 1529 aa37.67■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 CCDC125Q86Z20 511 aa37.67■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 CABLES1Q8TDN4 633 aa37.64■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 DLC1Q96QB1 1528 aa37.64■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.64■■■■□ 3.62
E2F4-213ENST00000569573 SBNO1A3KN83 1393 aa37.63■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.62■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF10O15013 1369 aa37.62■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa37.61■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 TRAK1Q9UPV9 953 aa37.6■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.6■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.59■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 GLI3P10071 1580 aa37.58■■■■□ 3.61
E2F4-213ENST00000569573 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.55■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 ADGRB1O14514 1584 aa37.54■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 ADGRB2O60241 1585 aa37.54■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 VPS72Q15906 364 aa37.53■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
E2F4-213ENST00000569573 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.51■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.5■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 SEPT12Q8IYM1 358 aa37.5■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 EP400Q96L91 3159 aa37.49■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 ABCA3Q99758 1704 aa37.48■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.48■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 STAC3Q96MF2 364 aa37.47■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 A0A0G2JS52 829 aa37.45■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 MYT1Q01538 1121 aa37.45■■■■□ 3.59
E2F4-213ENST00000569573 FAM83GA6ND36 823 aa37.44■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 WASLO00401 505 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 TULP4Q9NRJ4 1543 aa37.42■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 BRWD3Q6RI45 1802 aa37.42■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 PRR36Q9H6K5 1346 aa37.4■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 KRT27Q7Z3Y8 459 aa37.39■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
E2F4-213ENST00000569573 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
E2F4-213ENST00000569573 BTG4Q9NY30 223 aa37.37■■■■□ 3.57
E2F4-213ENST00000569573 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
E2F4-213ENST00000569573 HRCP23327 699 aa37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms