RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.71■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
INO80E-212ENST00000568043 MYOM2P54296 1465 aa27.68■■■□□ 2.02
INO80E-212ENST00000568043 HFM1A2PYH4 1435 aa27.67■■■□□ 2.02
INO80E-212ENST00000568043 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.65■■■□□ 2.02
INO80E-212ENST00000568043 PXDNQ92626 1479 aa27.65■■■□□ 2.02
INO80E-212ENST00000568043 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.64■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.63■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.62■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.6■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 FOXO3O43524 673 aa27.59■■■□□ 2.01
INO80E-212ENST00000568043 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.55■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 NUTM2FA1L443 756 aa27.54■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.54■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.53■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 FOXD1Q16676 465 aa27.52■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 GLI3P10071 1580 aa27.52■■■□□ 2
INO80E-212ENST00000568043 TECPR2O15040 1411 aa27.51■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.51■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 IFT172Q9UG01 1749 aa27.5■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.5■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 STK26Q9P289 416 aa27.5■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 SLIT2O94813 1529 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 CCDC125Q86Z20 511 aa27.48■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.47■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.46■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.45■■□□□ 1.99
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.45■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.45■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 RGL3Q3MIN7 710 aa27.44■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 ABCC11Q96J66 1382 aa27.44■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 USP32Q8NFA0 1604 aa27.42■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 KIF1AQ12756 1690 aa27.41■■□□□ 1.98
INO80E-212ENST00000568043 PIK3C2GO75747 1445 aa27.39■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.38■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.38■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.37■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.37■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.35■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.35■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 ABCA3Q99758 1704 aa27.34■■□□□ 1.97
INO80E-212ENST00000568043 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.32■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.32■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.32■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 VPS72Q15906 364 aa27.3■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 SIRT1Q96EB6 747 aa27.29■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.29■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.29■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHG5O94827 1062 aa27.28■■□□□ 1.96
INO80E-212ENST00000568043 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.26■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 SBNO1A3KN83 1393 aa27.24■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 FAM83GA6ND36 823 aa27.23■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 PSME1Q06323 249 aa27.23■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.23■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 NRAPQ86VF7 1730 aa27.22■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.22■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 LRP5O75197 1615 aa27.21■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
INO80E-212ENST00000568043 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.2■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 PRAM1Q96QH2 718 aa27.19■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.18■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF10O15013 1369 aa27.18■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 ALS2Q96Q42 1657 aa27.15■■□□□ 1.94
INO80E-212ENST00000568043 DLC1Q96QB1 1528 aa27.13■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.12■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 ADGRB2O60241 1585 aa27.12■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 BTG4Q9NY30 223 aa27.11■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.1■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 FAM182BQ5T319 152 aa27.09■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.09■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 ADGRB1O14514 1584 aa27.09■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 A0A0G2JS52 829 aa27.08■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 HRCP23327 699 aa27.08■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 BAG6P46379 1132 aa27.08■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 MYT1Q01538 1121 aa27.08■■□□□ 1.93
INO80E-212ENST00000568043 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 POGKQ9P215 609 aa27.07■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
INO80E-212ENST00000568043 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.06■■□□□ 1.92
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