RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
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STX4-216ENST00000566353 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
STX4-216ENST00000566353 PIK3C2GO75747 1445 aa31.41■■■□□ 2.62
STX4-216ENST00000566353 ADAMTS2O95450 1211 aa31.41■■■□□ 2.62
STX4-216ENST00000566353 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
STX4-216ENST00000566353 RGS12O14924 1447 aa31.41■■■□□ 2.62
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STX4-216ENST00000566353 ABCC11Q96J66 1382 aa31.36■■■□□ 2.61
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STX4-216ENST00000566353 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.35■■■□□ 2.61
STX4-216ENST00000566353 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.35■■■□□ 2.61
STX4-216ENST00000566353 MYOM2P54296 1465 aa31.33■■■□□ 2.61
STX4-216ENST00000566353 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.33■■■□□ 2.61
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STX4-216ENST00000566353 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.28■■■□□ 2.6
STX4-216ENST00000566353 NUTM2FA1L443 756 aa31.28■■■□□ 2.6
STX4-216ENST00000566353 FOXO3O43524 673 aa31.27■■■□□ 2.6
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STX4-216ENST00000566353 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
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STX4-216ENST00000566353 USP32Q8NFA0 1604 aa31.12■■■□□ 2.57
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STX4-216ENST00000566353 ADGRB2O60241 1585 aa31.09■■■□□ 2.57
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STX4-216ENST00000566353 UNC5CLQ8IV45 518 aa31■■■□□ 2.55
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STX4-216ENST00000566353 STAC3Q96MF2 364 aa30.86■■■□□ 2.53
STX4-216ENST00000566353 HRCP23327 699 aa30.85■■■□□ 2.53
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STX4-216ENST00000566353 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
STX4-216ENST00000566353 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
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STX4-216ENST00000566353 FAM83GA6ND36 823 aa30.79■■■□□ 2.52
STX4-216ENST00000566353 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.79■■■□□ 2.52
STX4-216ENST00000566353 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.78■■■□□ 2.52
STX4-216ENST00000566353 ATP7BP35670 1465 aa30.77■■■□□ 2.52
STX4-216ENST00000566353 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.75■■■□□ 2.51
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