RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 JCADQ9P266 1359 aa34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-216ENST00000565787 SIRT1Q96EB6 747 aa34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-216ENST00000565787 SHPRHQ149N8 1683 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-216ENST00000565787 DLC1Q96QB1 1528 aa34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-216ENST00000565787 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-216ENST00000565787 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-216ENST00000565787 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-216ENST00000565787 ORAI2Q96SN7 254 aa34.4■■■■□ 3.1
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CHTF18-216ENST00000565787 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.33■■■■□ 3.09
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CHTF18-216ENST00000565787 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.31■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.3■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRB2O60241 1585 aa34.3■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
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CHTF18-216ENST00000565787 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
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CHTF18-216ENST00000565787 NUTM2FA1L443 756 aa34.27■■■■□ 3.08
CHTF18-216ENST00000565787 KIF1AQ12756 1690 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-216ENST00000565787 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.23■■■■□ 3.07
CHTF18-216ENST00000565787 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.23■■■■□ 3.07
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CHTF18-216ENST00000565787 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.21■■■■□ 3.07
CHTF18-216ENST00000565787 USP32Q8NFA0 1604 aa34.2■■■■□ 3.07
CHTF18-216ENST00000565787 NEUROD1Q13562 356 aa34.2■■■■□ 3.07
CHTF18-216ENST00000565787 FOXO3O43524 673 aa34.17■■■■□ 3.06
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CHTF18-216ENST00000565787 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CHTF18-216ENST00000565787 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-216ENST00000565787 SOCS7O14512 581 aa34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-216ENST00000565787 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
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CHTF18-216ENST00000565787 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-216ENST00000565787 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-216ENST00000565787 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
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CHTF18-216ENST00000565787 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
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CHTF18-216ENST00000565787 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-216ENST00000565787 TONSLQ96HA7 1378 aa33.95■■■■□ 3.02
CHTF18-216ENST00000565787 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.95■■■■□ 3.02
CHTF18-216ENST00000565787 ADAMTS2O95450 1211 aa33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-216ENST00000565787 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.94■■■■□ 3.02
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CHTF18-216ENST00000565787 SBNO1A3KN83 1393 aa33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-216ENST00000565787 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
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CHTF18-216ENST00000565787 CDK19Q9BWU1 502 aa33.93■■■■□ 3.02
CHTF18-216ENST00000565787 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
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CHTF18-216ENST00000565787 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
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CHTF18-216ENST00000565787 USP21Q9UK80 565 aa33.74■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 ACEP12821 1306 aa33.74■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa33.72■■■□□ 2.99
CHTF18-216ENST00000565787 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.71■■■□□ 2.99
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CHTF18-216ENST00000565787 EVC2Q86UK5 1308 aa33.71■■■□□ 2.99
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