RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565483.1

STX4-215, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 5

Gene STX4, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-215	ENST00000565483	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.26	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	AFF2	P51816	1311 aa		32.26	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.25	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	TECPR2	O15040	1411 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.23	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	LAMC1	P11047	1609 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STX4-215	ENST00000565483	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.19	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	RXRB	P28702	533 aa		32.17	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.17	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.15	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	FOXO3	O43524	673 aa		32.14	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	MYOM2	P54296	1465 aa		32.14	■■■□□ 2.74
STX4-215	ENST00000565483	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.12	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.11	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	PXDN	Q92626	1479 aa		32.09	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
STX4-215	ENST00000565483	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.07	■■■□□ 2.72
STX4-215	ENST00000565483	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.06	■■■□□ 2.72
STX4-215	ENST00000565483	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.06	■■■□□ 2.72
STX4-215	ENST00000565483	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.04	■■■□□ 2.72
STX4-215	ENST00000565483	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
STX4-215	ENST00000565483	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.01	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	POGK	Q9P215	609 aa		32	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	USP21	Q9UK80	565 aa		31.99	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	RGS12	O14924	1447 aa		31.98	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.96	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.95	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	HRC	P23327	699 aa		31.95	■■■□□ 2.71
STX4-215	ENST00000565483	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.94	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.94	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.94	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.92	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.91	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.91	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
STX4-215	ENST00000565483	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.87	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	ATRN	O75882	1429 aa		31.85	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.84	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.83	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	PSME1	Q06323	249 aa		31.83	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		31.83	■■■□□ 2.69
STX4-215	ENST00000565483	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.82	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.82	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.81	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.8	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.79	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.77	■■■□□ 2.68
STX4-215	ENST00000565483	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.75	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.72	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		31.71	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	SLIT2	O94813	1529 aa		31.7	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.7	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.7	■■■□□ 2.67
STX4-215	ENST00000565483	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.67	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.65	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	EP400	Q96L91	3159 aa		31.65	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.65	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.64	■■■□□ 2.66
STX4-215	ENST00000565483	GLI3	P10071	1580 aa		31.63	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.6	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.6	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	ATP7B	P35670	1465 aa		31.59	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.59	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.57	■■■□□ 2.65
STX4-215	ENST00000565483	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.56	■■■□□ 2.64
STX4-215	ENST00000565483	VPS72	Q15906	364 aa		31.56	■■■□□ 2.64
STX4-215	ENST00000565483	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.53	■■■□□ 2.64
STX4-215	ENST00000565483	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.52	■■■□□ 2.64
STX4-215	ENST00000565483	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.52	■■■□□ 2.64
STX4-215	ENST00000565483	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.51	■■■□□ 2.63
STX4-215	ENST00000565483	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.51	■■■□□ 2.63

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