RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.75■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 STK26Q9P289 416 aa29.74■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.73■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.73■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.72■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
MFGE8-208ENST00000558773 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.7■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.69■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 AFF2P51816 1311 aa29.69■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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MFGE8-208ENST00000558773 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.66■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 MYOM2P54296 1465 aa29.66■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 RXRBP28702 533 aa29.65■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.65■■■□□ 2.34
MFGE8-208ENST00000558773 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.62■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 C8orf37Q96NL8 207 aa29.62■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.62■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 HRCP23327 699 aa29.6■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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MFGE8-208ENST00000558773 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
MFGE8-208ENST00000558773 FOXO3O43524 673 aa29.57■■■□□ 2.32
MFGE8-208ENST00000558773 ADAMTS2O95450 1211 aa29.57■■■□□ 2.32
MFGE8-208ENST00000558773 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.57■■■□□ 2.32
MFGE8-208ENST00000558773 NUTM2FA1L443 756 aa29.56■■■□□ 2.32
MFGE8-208ENST00000558773 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
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MFGE8-208ENST00000558773 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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MFGE8-208ENST00000558773 DLC1Q96QB1 1528 aa29.49■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 PRAM1Q96QH2 718 aa29.48■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 ADGRB1O14514 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 KIF1AQ12756 1690 aa29.47■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 STAC3Q96MF2 364 aa29.46■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 USP21Q9UK80 565 aa29.46■■■□□ 2.31
MFGE8-208ENST00000558773 RGS12O14924 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.44■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 POGKQ9P215 609 aa29.41■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
MFGE8-208ENST00000558773 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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MFGE8-208ENST00000558773 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.38■■■□□ 2.29
MFGE8-208ENST00000558773 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.37■■■□□ 2.29
MFGE8-208ENST00000558773 ADGRB2O60241 1585 aa29.37■■■□□ 2.29
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MFGE8-208ENST00000558773 USP32Q8NFA0 1604 aa29.34■■■□□ 2.29
MFGE8-208ENST00000558773 SBNO1A3KN83 1393 aa29.32■■■□□ 2.28
MFGE8-208ENST00000558773 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.31■■■□□ 2.28
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MFGE8-208ENST00000558773 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MFGE8-208ENST00000558773 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.26■■■□□ 2.27
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MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF10O15013 1369 aa29.24■■■□□ 2.27
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MFGE8-208ENST00000558773 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.23■■■□□ 2.27
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MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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MFGE8-208ENST00000558773 CDK19Q9BWU1 502 aa29.09■■■□□ 2.25
MFGE8-208ENST00000558773 ITSN1Q15811 1721 aa29.08■■■□□ 2.25
MFGE8-208ENST00000558773 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC125Q86Z20 511 aa29.06■■■□□ 2.24
MFGE8-208ENST00000558773 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.03■■■□□ 2.24
MFGE8-208ENST00000558773 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.02■■■□□ 2.24
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