RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPSB2	Q99619	263 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTMR2	Q13614	643 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADH1B	P00325	375 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0G2JS52	829 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	RGS20	O76081	388 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	HLA-C	Q95604	372 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.54	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	HRC	P23327	699 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.53	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
PAPOLA-222	ENST00000556787	TLL1	O43897	1013 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	LILRB3	O75022	631 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSC1	Q92574	1164 aa		10.52	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.51	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	S1PR4	O95977	384 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	JUND	P17535	347 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	QPCT	Q16769	361 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP16	P51512	607 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	AP1G2	O75843	785 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	RFC5	P40937	340 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	APBB1	O00213	710 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTPRN	Q16849	979 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	CFAP99	D6REC4	459 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTH	P32929	405 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPIA	P49247	311 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC19A1	P41440	591 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	FLII	Q13045	1269 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	SOCS7	O14512	581 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM32	Q13049	653 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	WNT7B	P56706	349 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGER	Q15109	404 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAD21	O60216	631 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR6A1	Q15406	480 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787		Q6ZNB5	142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77

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