RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 TECPR2O15040 1411 aa25.35■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 PIK3C2GO75747 1445 aa25.33■■□□□ 1.65
TMX1-202ENST00000555574 STK26Q9P289 416 aa25.32■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTS2O95450 1211 aa25.31■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.28■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.28■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.28■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 RGS12O14924 1447 aa25.28■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 PXDNQ92626 1479 aa25.28■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.27■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.27■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 ABCC11Q96J66 1382 aa25.27■■□□□ 1.64
TMX1-202ENST00000555574 NGLY1Q96IV0 654 aa25.26■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.26■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 MYOM2P54296 1465 aa25.23■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 NUTM2FA1L443 756 aa25.23■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.22■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 FOXO3O43524 673 aa25.21■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 KIF1AQ12756 1690 aa25.2■■□□□ 1.63
TMX1-202ENST00000555574 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.19■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 USP21Q9UK80 565 aa25.18■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.15■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TMX1-202ENST00000555574 ATRNO75882 1429 aa25.13■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 SIRT1Q96EB6 747 aa25.11■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.09■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 DLC1Q96QB1 1528 aa25.09■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 PRAM1Q96QH2 718 aa25.08■■□□□ 1.61
TMX1-202ENST00000555574 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.08■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 ADGRB1O14514 1584 aa25.07■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 USP32Q8NFA0 1604 aa25.07■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.05■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 ADGRB2O60241 1585 aa25.05■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.05■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.04■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.03■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 ABCA3Q99758 1704 aa25.03■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 EP400Q96L91 3159 aa25.02■■□□□ 1.6
TMX1-202ENST00000555574 POGKQ9P215 609 aa25.01■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 SLIT2O94813 1529 aa25.01■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.99■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.98■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 GLI3P10071 1580 aa24.98■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 PSME1Q06323 249 aa24.98■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 SBNO1A3KN83 1393 aa24.97■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.97■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.97■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 PLEKHG5O94827 1062 aa24.96■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.96■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.96■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
TMX1-202ENST00000555574 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.95■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.95■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.95■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.94■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF10O15013 1369 aa24.93■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.93■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.93■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 ALS2Q96Q42 1657 aa24.91■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.91■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.89■■□□□ 1.58
TMX1-202ENST00000555574 HRCP23327 699 aa24.88■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 ITSN1Q15811 1721 aa24.86■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 STAC3Q96MF2 364 aa24.86■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.85■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 NRAPQ86VF7 1730 aa24.85■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.84■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 VPS72Q15906 364 aa24.84■■□□□ 1.57
TMX1-202ENST00000555574 ATP7BP35670 1465 aa24.82■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 CCDC125Q86Z20 511 aa24.81■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 FAM83GA6ND36 823 aa24.8■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.8■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.8■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.8■■□□□ 1.56
TMX1-202ENST00000555574 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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