RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 TOM1O60784 492 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 ATF3P18847 181 aa26.68■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 PIP4K2BP78356 416 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.64■■□□□ 1.86
CTDSP2-207ENST00000551594 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 FBXO41Q8TF61 875 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 SLAIN2Q9P270 581 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 DCCP43146 1447 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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CTDSP2-207ENST00000551594 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 NUTM2FA1L443 756 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDSP2-207ENST00000551594 MST1RQ04912 1400 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRB2O60241 1585 aa26.56■■□□□ 1.84
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CTDSP2-207ENST00000551594 USP47Q96K76 1375 aa26.55■■□□□ 1.84
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CTDSP2-207ENST00000551594 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-207ENST00000551594 CDK19Q9BWU1 502 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDSP2-207ENST00000551594 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.51■■□□□ 1.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 BRINP3Q76B58 766 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 USP32Q8NFA0 1604 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TESK2Q96S53 571 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDSP2-207ENST00000551594 CABP2Q9NPB3 220 aa26.45■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 EVC2Q86UK5 1308 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 HSPA1LP34931 641 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP7BP35670 1465 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDSP2-207ENST00000551594 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.38■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 PHLPP1O60346 1717 aa26.34■■□□□ 1.81
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDSP2-207ENST00000551594 ITSN1Q15811 1721 aa26.34■■□□□ 1.81
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CTDSP2-207ENST00000551594 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 TMF1P82094 1093 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 CABP1Q9NZU7 370 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC24A1O60721 1099 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDSP2-207ENST00000551594 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 ACEP12821 1306 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 PSME1Q06323 249 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 PXDNQ92626 1479 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 TMC1Q8TDI8 760 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTDSP2-207ENST00000551594 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CTDSP2-207ENST00000551594 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.21■■□□□ 1.79
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CTDSP2-207ENST00000551594 MYOM1P52179 1685 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 USP6P35125 1406 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 SHPRHQ149N8 1683 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A1W2PP64 1363 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDSP2-207ENST00000551594 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.09■■□□□ 1.77
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