RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CS-221ENST00000550734 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.29■□□□□ 0.36
CS-221ENST00000550734 ATRNO75882 1429 aa17.28■□□□□ 0.36
CS-221ENST00000550734 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 MYOM2P54296 1465 aa17.26■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 PPLO60437 1756 aa17.26■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa17.24■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.24■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 PXDNQ92626 1479 aa17.24■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.23■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 CCDC125Q86Z20 511 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-221ENST00000550734 FOXD1Q16676 465 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 TECPR2O15040 1411 aa17.19■□□□□ 0.34
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CS-221ENST00000550734 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 FOXO3O43524 673 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.16■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.15■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 ABCC11Q96J66 1382 aa17.15■□□□□ 0.34
CS-221ENST00000550734 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 SLIT2O94813 1529 aa17.14■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.13■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.13■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 UNC5CLQ8IV45 518 aa17.13■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 IFT172Q9UG01 1749 aa17.13■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 GLI3P10071 1580 aa17.12■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.12■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 FMN2Q9NZ56 1722 aa17.12■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.12■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.12■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 KIF1AQ12756 1690 aa17.11■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.11■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 HRCP23327 699 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 STK26Q9P289 416 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 NUTM2FA1L443 756 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 SIRT1Q96EB6 747 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 USP32Q8NFA0 1604 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.09■□□□□ 0.33
CS-221ENST00000550734 PIK3C2GO75747 1445 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.08■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.07■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
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CS-221ENST00000550734 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 VPS72Q15906 364 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.04■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.03■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 SBNO1A3KN83 1393 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 PSME1Q06323 249 aa17.02■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CS-221ENST00000550734 PHF8Q9UPP1 1060 aa17.02■□□□□ 0.32
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CS-221ENST00000550734 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 ABCA3Q99758 1704 aa17.01■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 ARHGEF10O15013 1369 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 LRP5O75197 1615 aa16.98■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.97■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 FAM83GA6ND36 823 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-221ENST00000550734 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 NRAPQ86VF7 1730 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 DLC1Q96QB1 1528 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.95■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 PRAM1Q96QH2 718 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 ADGRB2O60241 1585 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 ALS2Q96Q42 1657 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
CS-221ENST00000550734 STAC3Q96MF2 364 aa16.9■□□□□ 0.3
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CS-221ENST00000550734 BAG6P46379 1132 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 BTG4Q9NY30 223 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 ADGRB1O14514 1584 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 POGKQ9P215 609 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 DISP2A7MBM2 1401 aa16.86■□□□□ 0.29
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