RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 MST1RQ04912 1400 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 USP32Q8NFA0 1604 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 ITSN1Q15811 1721 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-211ENST00000548041 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.41□□□□□ -0.42
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CS-211ENST00000548041 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
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CS-211ENST00000548041 PRAM1Q96QH2 718 aa12.4□□□□□ -0.42
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CS-211ENST00000548041 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 SLAIN2Q9P270 581 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.38□□□□□ -0.43
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CS-211ENST00000548041 SHPRHQ149N8 1683 aa12.37□□□□□ -0.43
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CS-211ENST00000548041 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 NUTM2FA1L443 756 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 BRINP3Q76B58 766 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-211ENST00000548041 ORAI2Q96SN7 254 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 ATP7BP35670 1465 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 ABCA3Q99758 1704 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 ANKARQ7Z5J8 1434 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 PXDNQ92626 1479 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 AKAP12Q02952 1782 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 CARD11Q9BXL7 1154 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 ALS2Q96Q42 1657 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-211ENST00000548041 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 LRP6O75581 1613 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 CDK19Q9BWU1 502 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 FOXO3O43524 673 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 USP47Q96K76 1375 aa12.24□□□□□ -0.45
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CS-211ENST00000548041 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 MYOM1P52179 1685 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 CABP2Q9NPB3 220 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-211ENST00000548041 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 EVC2Q86UK5 1308 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 PIK3C2AO00443 1686 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 PLCH1Q4KWH8 1693 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 TESK2Q96S53 571 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 ACEP12821 1306 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 SBNO1A3KN83 1393 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 PSME1Q06323 249 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 USP54Q70EL1 1684 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-211ENST00000548041 USP6P35125 1406 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 PLEKHG3A1L390 1219 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 CABP1Q9NZU7 370 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
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