RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 AGLP35573 1532 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 RAPGEF3O95398 923 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 SLFN5Q08AF3 891 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 MORC1Q86VD1 984 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 CFAP53Q96M91 514 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.77□□□□□ -0.36
CS-205ENST00000546891 MSH5O43196 834 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 CRBNQ96SW2 442 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 APAF1O14727 1248 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 IDI1Q13907 227 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 MED14O60244 1454 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 RUNDC1Q96C34 613 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 SHPRHQ149N8 1683 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 AAMPQ13685 434 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 DLC1Q96QB1 1528 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 ABCC11Q96J66 1382 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 CCDC27Q2M243 656 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 PTPRMP28827 1452 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 WDR63Q8IWG1 891 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 PLIN1O60240 522 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 PDE3AQ14432 1141 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-205ENST00000546891 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 WWC1Q8IX03 1113 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 PDE4AP27815 886 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 BACH2Q9BYV9 841 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 POGKQ9P215 609 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ALKQ9UM73 1620 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ADGRB2O60241 1585 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 MTHFSP49914 203 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PP64 1363 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 ATP7BP35670 1465 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 CABP2Q9NPB3 220 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 PRAM1Q96QH2 718 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-205ENST00000546891 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 STK26Q9P289 416 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 IL16Q14005 1332 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 NLRP1Q9C000 1473 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 ZMYM3Q14202 1370 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 SIRT1Q96EB6 747 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 FAM161AQ3B820 660 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 CDK19Q9BWU1 502 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 KNDC1Q76NI1 1749 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms