RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 DIP2AQ14689 1571 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CPS1P31327 1500 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 TECPR2O15040 1411 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 SLC24A1O60721 1099 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 NLRP13Q86W25 1043 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 INSRP06213 1382 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 METP08581 1390 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 SHPRHQ149N8 1683 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 ABCC11Q96J66 1382 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 EID1Q9Y6B2 187 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 LTKP29376 864 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 PPP2R1AP30153 589 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-203ENST00000546585 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.4□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.4□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ADGRB2O60241 1585 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 TMC1Q8TDI8 760 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 PTPRUQ92729 1446 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 PRAM1Q96QH2 718 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 A0A1W2PP64 1363 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 EVC2Q86UK5 1308 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 AKAP12Q02952 1782 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 SIRT1Q96EB6 747 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 STK26Q9P289 416 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 TBX22Q9Y458 520 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 CABP2Q9NPB3 220 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 PIK3R4Q99570 1358 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 BCANQ96GW7 911 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 PTCH1Q13635 1447 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 ATP7BP35670 1465 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-203ENST00000546585 STRCQ7RTU9 1775 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NSD2O96028 1365 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 ZNF521Q96K83 1311 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NWD1Q149M9 1564 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 CDK19Q9BWU1 502 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 POGKQ9P215 609 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 ITSN1Q15811 1721 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NUDCQ9Y266 331 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 FYB1O15117 783 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 FKBP8Q14318 412 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 CABP1Q9NZU7 370 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
CS-203ENST00000546585 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 SSH2Q76I76 1423 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms