RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 NEUROD1Q13562 356 aa40.47■■■■■ 4.07
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ESRRA-206ENST00000539594 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.44■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 PRAM1Q96QH2 718 aa40.43■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 POGKQ9P215 609 aa40.42■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.41■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.39■■■■■ 4.06
ESRRA-206ENST00000539594 JCADQ9P266 1359 aa40.37■■■■■ 4.05
ESRRA-206ENST00000539594 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.34■■■■■ 4.05
ESRRA-206ENST00000539594 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.04
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ESRRA-206ENST00000539594 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ESRRA-206ENST00000539594 ADGRB2O60241 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
ESRRA-206ENST00000539594 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.29■■■■■ 4.04
ESRRA-206ENST00000539594 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.27■■■■■ 4.04
ESRRA-206ENST00000539594 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.25■■■■■ 4.03
ESRRA-206ENST00000539594 TONSLQ96HA7 1378 aa40.24■■■■■ 4.03
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ESRRA-206ENST00000539594 NUTM2FA1L443 756 aa40.22■■■■■ 4.03
ESRRA-206ENST00000539594 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.2■■■■■ 4.03
ESRRA-206ENST00000539594 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.2■■■■■ 4.03
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ESRRA-206ENST00000539594 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
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ESRRA-206ENST00000539594 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.16■■■■■ 4.02
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ESRRA-206ENST00000539594 ITSN1Q15811 1721 aa39.96■■■■□ 3.99
ESRRA-206ENST00000539594 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.96■■■■□ 3.99
ESRRA-206ENST00000539594 PSME1Q06323 249 aa39.96■■■■□ 3.99
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ESRRA-206ENST00000539594 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
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ESRRA-206ENST00000539594 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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ESRRA-206ENST00000539594 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.84■■■■□ 3.97
ESRRA-206ENST00000539594 TNS3Q68CZ2 1445 aa39.83■■■■□ 3.97
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ESRRA-206ENST00000539594 EVC2Q86UK5 1308 aa39.8■■■■□ 3.96
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ESRRA-206ENST00000539594 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.6■■■■□ 3.93
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ESRRA-206ENST00000539594 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
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