RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	POGK	Q9P215	609 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	ATF3	P18847	181 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	MST1R	Q04912	1400 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	TOM1	O60784	492 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MLH1-222	ENST00000539477	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.21	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	ADGRB2	O60241	1585 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	DCC	P43146	1447 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	USP47	Q96K76	1375 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	HSPA1L	P34931	641 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MLH1-222	ENST00000539477	ATP7B	P35670	1465 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	FOXO3	O43524	673 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	TESK2	Q96S53	571 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.08	□□□□□ -0.31
MLH1-222	ENST00000539477	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	EP400	Q96L91	3159 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	EVC2	Q86UK5	1308 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	PXDN	Q92626	1479 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	MYOM1	P52179	1685 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	ACE	P12821	1306 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.02	□□□□□ -0.32
MLH1-222	ENST00000539477	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	PSME1	Q06323	249 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	ABCA3	Q99758	1704 aa		13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	LRP6	O75581	1613 aa		13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	TMF1	P82094	1093 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477		A0A1W2PP64	1363 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.97	□□□□□ -0.33

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