RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.02■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
PKP3-210ENST00000533249 ESCO1Q5FWF5 840 aa34■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 NGLY1Q96IV0 654 aa34■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.99■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.99■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 TECPR2O15040 1411 aa33.96■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 NUTM2FA1L443 756 aa33.95■■■■□ 3.03
PKP3-210ENST00000533249 PIK3C2GO75747 1445 aa33.95■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.94■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 ABCC11Q96J66 1382 aa33.93■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.93■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.93■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 RGS12O14924 1447 aa33.92■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 FOXO3O43524 673 aa33.9■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
PKP3-210ENST00000533249 PXDNQ92626 1479 aa33.88■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 USP21Q9UK80 565 aa33.87■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 MYOM2P54296 1465 aa33.83■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 FMN2Q9NZ56 1722 aa33.83■■■■□ 3.01
PKP3-210ENST00000533249 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.8■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.79■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.78■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
PKP3-210ENST00000533249 SIRT1Q96EB6 747 aa33.76■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 KIF1AQ12756 1690 aa33.75■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 ATRNO75882 1429 aa33.74■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.7■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 PRAM1Q96QH2 718 aa33.7■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.7■■■□□ 2.99
PKP3-210ENST00000533249 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.69■■■□□ 2.98
PKP3-210ENST00000533249 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.67■■■□□ 2.98
PKP3-210ENST00000533249 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.67■■■□□ 2.98
PKP3-210ENST00000533249 POGKQ9P215 609 aa33.64■■■□□ 2.98
PKP3-210ENST00000533249 DLC1Q96QB1 1528 aa33.61■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHG5O94827 1062 aa33.6■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 PSME1Q06323 249 aa33.6■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.6■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.59■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 ADGRB1O14514 1584 aa33.58■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 USP32Q8NFA0 1604 aa33.57■■■□□ 2.97
PKP3-210ENST00000533249 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.57■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.56■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.56■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.56■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 SLIT2O94813 1529 aa33.55■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.55■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.55■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 ADGRB2O60241 1585 aa33.53■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.53■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 SBNO1A3KN83 1393 aa33.52■■■□□ 2.96
PKP3-210ENST00000533249 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
PKP3-210ENST00000533249 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.5■■■□□ 2.95
PKP3-210ENST00000533249 GLI3P10071 1580 aa33.49■■■□□ 2.95
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF10O15013 1369 aa33.48■■■□□ 2.95
PKP3-210ENST00000533249 ABCA3Q99758 1704 aa33.47■■■□□ 2.95
PKP3-210ENST00000533249 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.44■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 HRCP23327 699 aa33.42■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 STAC3Q96MF2 364 aa33.42■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.42■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.41■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 EP400Q96L91 3159 aa33.4■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.39■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.39■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 VPS72Q15906 364 aa33.39■■■□□ 2.94
PKP3-210ENST00000533249 CCDC125Q86Z20 511 aa33.38■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.37■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 FAM83GA6ND36 823 aa33.35■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.35■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 ALS2Q96Q42 1657 aa33.34■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PKP3-210ENST00000533249 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.31■■■□□ 2.92
PKP3-210ENST00000533249 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
PKP3-210ENST00000533249 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
PKP3-210ENST00000533249 BTG4Q9NY30 223 aa33.27■■■□□ 2.92
PKP3-210ENST00000533249 NRAPQ86VF7 1730 aa33.26■■■□□ 2.92
PKP3-210ENST00000533249 ATP7BP35670 1465 aa33.25■■■□□ 2.91
PKP3-210ENST00000533249 ITSN1Q15811 1721 aa33.25■■■□□ 2.91
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