RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRK-222	ENST00000532751	POGK	Q9P215	609 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRK-222	ENST00000532751	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRK-222	ENST00000532751	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRK-222	ENST00000532751	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.5	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRK-222	ENST00000532751	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PTPRK-222	ENST00000532751	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PTPRK-222	ENST00000532751	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRK-222	ENST00000532751	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRK-222	ENST00000532751	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	FOXO3	O43524	673 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PTPRK-222	ENST00000532751	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	PXDN	Q92626	1479 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP7B	P35670	1465 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRK-222	ENST00000532751	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	PSME1	Q06323	249 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRK-222	ENST00000532751	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	LRP6	O75581	1613 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PTPRK-222	ENST00000532751	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	ACE	P12821	1306 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGEF10	O15013	1369 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PTPRK-222	ENST00000532751	USP47	Q96K76	1375 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC24A1	O60721	1099 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		30.93	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	ALS2	Q96Q42	1657 aa		30.92	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	CABP1	Q9NZU7	370 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	ADAMTS2	O95450	1211 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	30.89	■■■□□ 2.54
PTPRK-222	ENST00000532751	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	30.87	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	C8orf37	Q96NL8	207 aa		30.87	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	TESK2	Q96S53	571 aa		30.86	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	30.85	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCA3	Q99758	1704 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	ILDR2	Q71H61	639 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PTPRK-222	ENST00000532751	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	30.83	■■■□□ 2.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.4 ms