RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 TONSLQ96HA7 1378 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA1LP34931 641 aa27.38■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PHLPP1O60346 1717 aa27.36■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRB2O60241 1585 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAM1Q96QH2 718 aa27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-208ENST00000531226 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 POGKQ9P215 609 aa27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 BRINP3Q76B58 766 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 USP32Q8NFA0 1604 aa27.21■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF1AQ12756 1690 aa27.21■■□□□ 1.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 ORAI2Q96SN7 254 aa27.17■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 NUTM2FA1L443 756 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SHPRHQ149N8 1683 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 ITSN1Q15811 1721 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.14■■□□□ 1.94
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 JCADQ9P266 1359 aa27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-208ENST00000531226 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.07■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP7BP35670 1465 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PXDNQ92626 1479 aa27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXO3O43524 673 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK19Q9BWU1 502 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-208ENST00000531226 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 LRP6O75581 1613 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 EVC2Q86UK5 1308 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 ALS2Q96Q42 1657 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 CABP2Q9NPB3 220 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 ILDR2Q71H61 639 aa26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-208ENST00000531226 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.89■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SBNO1A3KN83 1393 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 USP47Q96K76 1375 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PSME1Q06323 249 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA3Q99758 1704 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 AKAP12Q02952 1782 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TESK2Q96S53 571 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ACEP12821 1306 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF10O15013 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CABP1Q9NZU7 370 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC24A1O60721 1099 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-208ENST00000531226 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-208ENST00000531226 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-208ENST00000531226 USP6P35125 1406 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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