RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.98■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC11Q96J66 1382 aa22.97■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.96■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RBBP4-218ENST00000527118 HRCP23327 699 aa22.95■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.93■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 NUTM2FA1L443 756 aa22.92■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.91■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.9■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RBBP4-218ENST00000527118 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.88■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 ADGRB1O14514 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 SIRT1Q96EB6 747 aa22.85■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 PXDNQ92626 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 PRAM1Q96QH2 718 aa22.84■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 KIF1AQ12756 1690 aa22.84■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 AFF2P51816 1311 aa22.83■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.83■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 DLC1Q96QB1 1528 aa22.83■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 FOXO3O43524 673 aa22.83■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 C8orf37Q96NL8 207 aa22.83■■□□□ 1.25
RBBP4-218ENST00000527118 ADAMTS2O95450 1211 aa22.81■■□□□ 1.24
RBBP4-218ENST00000527118 POGKQ9P215 609 aa22.8■■□□□ 1.24
RBBP4-218ENST00000527118 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.79■■□□□ 1.24
RBBP4-218ENST00000527118 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RBBP4-218ENST00000527118 USP32Q8NFA0 1604 aa22.77■■□□□ 1.24
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 ADGRB2O60241 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 RXRBP28702 533 aa22.75■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 NGLY1Q96IV0 654 aa22.75■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 STAC3Q96MF2 364 aa22.75■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.72■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.71■■□□□ 1.23
RBBP4-218ENST00000527118 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.7■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.68■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.67■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 USP21Q9UK80 565 aa22.67■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.66■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.65■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 ABCA3Q99758 1704 aa22.65■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 RGS12O14924 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
RBBP4-218ENST00000527118 PSME1Q06323 249 aa22.64■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.63■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 ITSN1Q15811 1721 aa22.63■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 PLEKHG5O94827 1062 aa22.63■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.61■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.61■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 SBNO1A3KN83 1393 aa22.61■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 ATRNO75882 1429 aa22.59■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.59■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.59■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 ALS2Q96Q42 1657 aa22.58■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
RBBP4-218ENST00000527118 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.56■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 ATP7BP35670 1465 aa22.56■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGEF10O15013 1369 aa22.56■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.56■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.55■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.54■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 SLIT2O94813 1529 aa22.54■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 NEUROD1Q13562 356 aa22.54■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.54■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 CDK19Q9BWU1 502 aa22.53■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.53■■□□□ 1.2
RBBP4-218ENST00000527118 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.51■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.51■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.5■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 GLI3P10071 1580 aa22.49■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RBBP4-218ENST00000527118 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.47■■□□□ 1.19
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