RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519376.5

FBXO25-208, Transcript of F-box protein 25, human

TSL 3

Gene FBXO25, Length 418 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO25-208	ENST00000519376	GIPC2	Q8TF65	315 aa		9.43	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	KCNB2	Q92953	911 aa		9.43	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	GLMN	Q92990	594 aa		9.43	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		9.43	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	MAF1	Q9H063	256 aa		9.43	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	TLDC2	A0PJX2	215 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	GPATCH3	Q96I76	525 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CLGN	O14967	610 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	PMM1	Q92871	262 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CCDC102A	Q96A19	550 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	EVI5L	Q96CN4	794 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CUX1	P39880	1505 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	PSME1	Q06323	249 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO25-208	ENST00000519376	MAP2K5	Q13163	448 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	PNMA2	Q9UL42	364 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	WDR97	A6NE52	1622 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	CARNS1	A5YM72	827 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	PAX3	P23760	479 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	C4orf46	Q504U0	113 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	SDE2	Q6IQ49	451 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	CASC1	Q6TDU7	716 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	BANK1	Q8NDB2	785 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	9.37	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	LNPK	Q9C0E8	428 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	9.36	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	SOX12	O15370	315 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	CXorf38	Q8TB03	319 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	IRF6	O14896	467 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	NRDC	O43847	1150 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	RFX1	P22670	979 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	SPACA7	Q96KW9	195 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	GRIN2B	Q13224	1484 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO25-208	ENST00000519376	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	KIF4A	O95239	1232 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	TTC36	A6NLP5	189 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	GPR37	O15354	613 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	SWAP70	Q9UH65	585 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	TOP2B	Q02880	1626 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	SCYL1	Q96KG9	808 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	PHF12	Q96QT6	1004 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	RECK	O95980	971 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	ZNF280D	Q6N043	979 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO25-208	ENST00000519376	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		9.3	□□□□□ -0.92

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