RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514495.1

CTBP1-214, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-214ENST00000514495 ORAI2Q96SN7 254 aa40.67■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 LAMC1P11047 1609 aa40.67■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 HRCP23327 699 aa40.65■■■■■ 4.1
CTBP1-214ENST00000514495 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
CTBP1-214ENST00000514495 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.61■■■■■ 4.09
CTBP1-214ENST00000514495 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.61■■■■■ 4.09
CTBP1-214ENST00000514495 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.58■■■■■ 4.09
CTBP1-214ENST00000514495 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CTBP1-214ENST00000514495 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.55■■■■■ 4.08
CTBP1-214ENST00000514495 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
CTBP1-214ENST00000514495 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CTBP1-214ENST00000514495 NUTM2FA1L443 756 aa40.52■■■■■ 4.08
CTBP1-214ENST00000514495 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.5■■■■■ 4.07
CTBP1-214ENST00000514495 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.49■■■■■ 4.07
CTBP1-214ENST00000514495 SIRT1Q96EB6 747 aa40.48■■■■■ 4.07
CTBP1-214ENST00000514495 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.47■■■■■ 4.07
CTBP1-214ENST00000514495 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.46■■■■■ 4.07
CTBP1-214ENST00000514495 AFF2P51816 1311 aa40.42■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.062e-8■■□□□ 13.3
CTBP1-214ENST00000514495 C8orf37Q96NL8 207 aa40.41■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 PRAM1Q96QH2 718 aa40.41■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 ADGRB1O14514 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 DLC1Q96QB1 1528 aa40.4■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 FOXO3O43524 673 aa40.39■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 PXDNQ92626 1479 aa40.39■■■■■ 4.06
CTBP1-214ENST00000514495 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 POGKQ9P215 609 aa40.37■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 KIF1AQ12756 1690 aa40.37■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 ADAMTS2O95450 1211 aa40.36■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 STAC3Q96MF2 364 aa40.35■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.33■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CTBP1-214ENST00000514495 RXRBP28702 533 aa40.3■■■■■ 4.04
CTBP1-214ENST00000514495 NGLY1Q96IV0 654 aa40.28■■■■■ 4.04
CTBP1-214ENST00000514495 ADGRB2O60241 1585 aa40.26■■■■■ 4.04
CTBP1-214ENST00000514495 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.23■■■■■ 4.03
CTBP1-214ENST00000514495 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
CTBP1-214ENST00000514495 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CTBP1-214ENST00000514495 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.19■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 USP32Q8NFA0 1604 aa40.18■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.17■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.16■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 USP21Q9UK80 565 aa40.14■■■■■ 4.02
CTBP1-214ENST00000514495 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 PSME1Q06323 249 aa40.12■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.1■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.1■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.1■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.08■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CTBP1-214ENST00000514495 RGS12O14924 1447 aa40.07■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 SBNO1A3KN83 1393 aa40.03■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.02■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.02■■■■■ 4
CTBP1-214ENST00000514495 PLEKHG5O94827 1062 aa40■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 ATRNO75882 1429 aa39.99■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.991e-6■■■■□ 25.6
CTBP1-214ENST00000514495 ARHGEF10O15013 1369 aa39.97■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 BCL9LQ86UU0 1499 aa39.95■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.95■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.95■■■■□ 3.99
CTBP1-214ENST00000514495 ITSN1Q15811 1721 aa39.94■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.94■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 ABCA3Q99758 1704 aa39.94■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.91■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 ATP7BP35670 1465 aa39.91■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.89■■■■□ 3.98
CTBP1-214ENST00000514495 SLIT2O94813 1529 aa39.87■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 NEUROD1Q13562 356 aa39.86■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 CDK19Q9BWU1 502 aa39.86■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 ALS2Q96Q42 1657 aa39.86■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.84■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 PLCH1Q4KWH8 1693 aa39.83■■■■□ 3.97
CTBP1-214ENST00000514495 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.8■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.77■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.76■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.76■■■■□ 3.96
CTBP1-214ENST00000514495 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.75■■■■□ 3.95
CTBP1-214ENST00000514495 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.75■■■■□ 3.95
CTBP1-214ENST00000514495 GLI3P10071 1580 aa39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms