RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 POTEAQ6S8J7 498 aa28.43■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 ORAI2Q96SN7 254 aa28.43■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
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CTBP1-211ENST00000511907 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTBP1-211ENST00000511907 NUTM2FA1L443 756 aa28.34■■■□□ 2.13
CTBP1-211ENST00000511907 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.34■■■□□ 2.13
CTBP1-211ENST00000511907 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTBP1-211ENST00000511907 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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CTBP1-211ENST00000511907 DLC1Q96QB1 1528 aa28.27■■■□□ 2.12
CTBP1-211ENST00000511907 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTBP1-211ENST00000511907 PXDNQ92626 1479 aa28.24■■■□□ 2.11
CTBP1-211ENST00000511907 KIF1AQ12756 1690 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTBP1-211ENST00000511907 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.22■■■□□ 2.11
CTBP1-211ENST00000511907 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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CTBP1-211ENST00000511907 C8orf37Q96NL8 207 aa28.21■■■□□ 2.11
CTBP1-211ENST00000511907 STAC3Q96MF2 364 aa28.2■■■□□ 2.1
CTBP1-211ENST00000511907 ADAMTS2O95450 1211 aa28.18■■■□□ 2.1
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRB2O60241 1585 aa28.17■■■□□ 2.1
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CTBP1-211ENST00000511907 USP32Q8NFA0 1604 aa28.14■■■□□ 2.1
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CTBP1-211ENST00000511907 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-211ENST00000511907 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CTBP1-211ENST00000511907 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.11■■■□□ 2.09
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CTBP1-211ENST00000511907 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-211ENST00000511907 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.08■■■□□ 2.09
CTBP1-211ENST00000511907 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.06■■■□□ 2.08
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CTBP1-211ENST00000511907 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.95■■■□□ 2.06
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CTBP1-211ENST00000511907 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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CTBP1-211ENST00000511907 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.89■■■□□ 2.06
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CTBP1-211ENST00000511907 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
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CTBP1-211ENST00000511907 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 GLI3P10071 1580 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-211ENST00000511907 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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