RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS2O95450 1211 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC11Q96J66 1382 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2FA1L443 756 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXO3O43524 673 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TECPR2O15040 1411 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMC1P11047 1609 aa28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3C2GO75747 1445 aa28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SIRT1Q96EB6 747 aa28.39■■■□□ 2.14
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT172Q9UG01 1749 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 USP21Q9UK80 565 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-220ENST00000511663 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SH3BP2-220ENST00000511663 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP2-220ENST00000511663 POGKQ9P215 609 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOM2P54296 1465 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2-220ENST00000511663 PXDNQ92626 1479 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2-220ENST00000511663 PSME1Q06323 249 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAM1Q96QH2 718 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS12O14924 1447 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 HRCP23327 699 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 STAC3Q96MF2 364 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF1AQ12756 1690 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 ATRNO75882 1429 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SH3BP2-220ENST00000511663 DLC1Q96QB1 1528 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHG5O94827 1062 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 SBNO1A3KN83 1393 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF10O15013 1369 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRB1O14514 1584 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC125Q86Z20 511 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SLIT2O94813 1529 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 USP32Q8NFA0 1604 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRB2O60241 1585 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS72Q15906 364 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM83GA6ND36 823 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JS52 829 aa27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MYT1Q01538 1121 aa27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2-220ENST00000511663 GLI3P10071 1580 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK19Q9BWU1 502 aa27.88■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 BTG4Q9NY30 223 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.86■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
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