RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510032.5

FAM200B-215, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 2

Gene FAM200B, Length 639 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-215	ENST00000510032	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FAM200B-215	ENST00000510032	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.25	■■■□□ 2.75
FAM200B-215	ENST00000510032	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAM200B-215	ENST00000510032	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAM200B-215	ENST00000510032	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.2	■■■□□ 2.74
FAM200B-215	ENST00000510032	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.19	■■■□□ 2.74
FAM200B-215	ENST00000510032	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.18	■■■□□ 2.74
FAM200B-215	ENST00000510032	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FAM200B-215	ENST00000510032	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FAM200B-215	ENST00000510032	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FAM200B-215	ENST00000510032	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FAM200B-215	ENST00000510032	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FAM200B-215	ENST00000510032	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
FAM200B-215	ENST00000510032	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.98	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.96	■■■□□ 2.71
FAM200B-215	ENST00000510032	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.93	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	FOXO3	O43524	673 aa		31.91	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.9	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FAM200B-215	ENST00000510032	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.82	■■■□□ 2.69
FAM200B-215	ENST00000510032	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	PSME1	Q06323	249 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	PXDN	Q92626	1479 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	ATP7B	P35670	1465 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FAM200B-215	ENST00000510032	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FAM200B-215	ENST00000510032	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.69	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.69	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	LRP6	O75581	1613 aa		31.68	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.68	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.66	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.66	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.65	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.65	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	USP47	Q96K76	1375 aa		31.65	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.64	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	ACE	P12821	1306 aa		31.64	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
FAM200B-215	ENST00000510032	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.65
FAM200B-215	ENST00000510032	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.63	■■■□□ 2.65
FAM200B-215	ENST00000510032	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
FAM200B-215	ENST00000510032	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.6	■■■□□ 2.65
FAM200B-215	ENST00000510032	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.58	■■■□□ 2.65
FAM200B-215	ENST00000510032	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	TESK2	Q96S53	571 aa		31.56	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.55	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.52	■■■□□ 2.64
FAM200B-215	ENST00000510032	TMF1	P82094	1093 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms