RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 LCE2BO14633 110 aa11.58□□□□□ -0.56
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PDE4D-217ENST00000509355 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 MS4A1P11836 297 aa11.56□□□□□ -0.56
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
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PDE4D-217ENST00000509355 PRR20CP86479 221 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 PRR20DP86480 221 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 PRR20BP86481 221 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-217ENST00000509355 PRR20AP86496 221 aa11.53□□□□□ -0.56
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PDE4D-217ENST00000509355 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.45□□□□□ -0.58
PDE4D-217ENST00000509355 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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PDE4D-217ENST00000509355 SPTLC1O15269 473 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4D-217ENST00000509355 FOXC1Q12948 553 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4D-217ENST00000509355 PKDCCQ504Y2 493 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-217ENST00000509355 C6orf229H3BNL8 230 aa11.41□□□□□ -0.58
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PDE4D-217ENST00000509355 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.38□□□□□ -0.59
PDE4D-217ENST00000509355 DESI1Q6ICB0 168 aa11.38□□□□□ -0.59
PDE4D-217ENST00000509355 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.37□□□□□ -0.59
PDE4D-217ENST00000509355 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
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PDE4D-217ENST00000509355 PRR7Q8TB68 274 aa11.37□□□□□ -0.59
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PDE4D-217ENST00000509355 LYPD8Q6UX82 237 aa11.31□□□□□ -0.6
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PDE4D-217ENST00000509355 SMPD1P17405 629 aa11.25□□□□□ -0.61
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PDE4D-217ENST00000509355 SH3BP2P78314 561 aa11.24□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.24□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 ST8SIA5O15466 376 aa11.22□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.22□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 J3QL48 77 aa11.21□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PDE4D-217ENST00000509355 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.21□□□□□ -0.61
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