RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 ORAI2Q96SN7 254 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 POTEAQ6S8J7 498 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-211ENST00000506932 ADGRB1O14514 1584 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2FA1L443 756 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-211ENST00000506932 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 DLC1Q96QB1 1528 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 PRAM1Q96QH2 718 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 PXDNQ92626 1479 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 SIRT1Q96EB6 747 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-211ENST00000506932 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF1AQ12756 1690 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 FOXO3O43524 673 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 USP32Q8NFA0 1604 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 ADGRB2O60241 1585 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 POGKQ9P215 609 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 AFF2P51816 1311 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-211ENST00000506932 ADAMTS2O95450 1211 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 C8orf37Q96NL8 207 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 STAC3Q96MF2 364 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-211ENST00000506932 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 NGLY1Q96IV0 654 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 RXRBP28702 533 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-211ENST00000506932 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
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SH3BP2-211ENST00000506932 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCA3Q99758 1704 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP7BP35670 1465 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 RGS12O14924 1447 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 ITSN1Q15811 1721 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 PLEKHG5O94827 1062 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 NEUROD1Q13562 356 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 USP21Q9UK80 565 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 SBNO1A3KN83 1393 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 PSME1Q06323 249 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-211ENST00000506932 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.64■■□□□ 1.21
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SH3BP2-211ENST00000506932 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 ATRNO75882 1429 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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SH3BP2-211ENST00000506932 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 ARHGEF10O15013 1369 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 SLIT2O94813 1529 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-211ENST00000506932 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 GLI3P10071 1580 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-211ENST00000506932 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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